AT2G19940.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : oxidoreductases, acting on the aldehyde or oxo group of donors, NAD or NADP as acceptor;copper ion binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
oxidoreductases, acting on the aldehyde or oxo group of donors, NAD or NADP as acceptor;copper ion binding; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors, NAD or NADP as acceptor, copper ion binding; INVOLVED IN: response to cadmium ion, cellular amino acid metabolic process; LOCATED IN: nucleolus, chloroplast stroma, chloroplast, membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Semialdehyde dehydrogenase, dimerisation domain (InterPro:IPR012280), Semialdehyde dehydrogenase, NAD-binding (InterPro:IPR000534), N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase (InterPro:IPR000706); Has 8034 Blast hits to 8033 proteins in 2187 species: Archae - 385; Bacteria - 4804; Metazoa - 0; Fungi - 163; Plants - 77; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2605 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:8613168..8615649 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44138.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 401 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSTASAFSSI QGCWFKGERK IRVADKRAKR LTLGSHVASP SSMSFRVSAS SSVKPEKDIR IGLLGASGYT GAEIVRLLAN HPHFQVTLMT ADRKAGQSME 101: SVFPHLRAQK LPTLVSVKDA DFSTVDAVFC CLPHGTTQEI IKELPTALKI VDLSADFRLR NIAEYEEWYG QPHKAVELQK EVVYGLTEIL REDIKKARLV 201: ANPGCYPTTI QLPLVPLLKA NLIKHENIII DAKSGVSGAG RGAKEANLYS EIAEGISSYG VTRHRHVPEI EQGLSDVAQS KVTVSFTPHL MPMIRGMQST 301: IYVEMAPGVR TEDLHQQLKT SYEDEEFVKV LDEGVVPRTH NVRGSNYCHM SVFPDRIPGR AIIISVIDNL VKGASGQALQ NLNIMLGYPE TTGLLHQPLF 401: P |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)