AT2G19860.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : hexokinase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with hexokinase activity (AtHXK2) and acts as a sensor for plant sugar responses. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
hexokinase 2 (HXK2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Hexokinase, N-terminal (InterPro:IPR022672), Hexokinase, conserved site (InterPro:IPR019807), Hexokinase, C-terminal (InterPro:IPR022673), Hexokinase (InterPro:IPR001312); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: hexokinase 1 (TAIR:AT4G29130.1); Has 2393 Blast hits to 2115 proteins in 319 species: Archae - 0; Bacteria - 88; Metazoa - 1275; Fungi - 598; Plants - 290; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 142 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:8571949..8573762 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42928.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 393 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRVLLGGKHD RVVKREFKEE SIPPHLMTGK SHELFDFIVD VLAKFVATEG EDFHLPPGRQ RELGFTFSFP VKQLSLSSGT LINWTKGFSI DDTVDKDVVG 101: ELVKAMERVG LDMLVAALVN DTIGTLAGGR YTNPDVVVAV ILGTGTNAAY VERAHAIPKW HGLLPKSGEM VINMEWGNFR SSHLPLTEYD HSLDVDSLNP 201: GEQILEKIIS GMYLGEILRR VLLKMAEEAA FFGDIVPPKL KIPFIIRTPN MSAMHSDTSP DLKVVGSKLK DILEVQTSSL KMRKVVISLC NIIASRGARL 301: SAAGIYGILK KIGRDATKDG EAQKSVIAMD GGLFEHYTQF SESMKSSLKE LLGDEVSESV EVILSNDGSG VGAALLAASH SQYLELEDDS ETS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)