AT2G19860.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : hexokinase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with hexokinase activity (AtHXK2) and acts as a sensor for plant sugar responses. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
hexokinase 2 (HXK2); FUNCTIONS IN: fructokinase activity, hexokinase activity, glucokinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: in 7 processes; LOCATED IN: mitochondrion, plastid; EXPRESSED IN: 28 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Hexokinase, N-terminal (InterPro:IPR022672), Hexokinase, conserved site (InterPro:IPR019807), Hexokinase, C-terminal (InterPro:IPR022673), Hexokinase (InterPro:IPR001312); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: hexokinase 1 (TAIR:AT4G29130.1); Has 2443 Blast hits to 2159 proteins in 323 species: Archae - 0; Bacteria - 89; Metazoa - 1303; Fungi - 623; Plants - 290; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 138 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:+:8570818..8573762 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 54493.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 5.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | 0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 502 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKVAVATTV VCSVAVCAAA ALIVRRRMKS AGKWARVIEI LKAFEEDCAT PIAKLRQVAD AMTVEMHAGL ASEGGSKLKM LISYVDNLPS GDETGFFYAL 101: DLGGTNFRVM RVLLGGKHDR VVKREFKEES IPPHLMTGKS HELFDFIVDV LAKFVATEGE DFHLPPGRQR ELGFTFSFPV KQLSLSSGTL INWTKGFSID 201: DTVDKDVVGE LVKAMERVGL DMLVAALVND TIGTLAGGRY TNPDVVVAVI LGTGTNAAYV ERAHAIPKWH GLLPKSGEMV INMEWGNFRS SHLPLTEYDH 301: SLDVDSLNPG EQILEKIISG MYLGEILRRV LLKMAEEAAF FGDIVPPKLK IPFIIRTPNM SAMHSDTSPD LKVVGSKLKD ILEVQTSSLK MRKVVISLCN 401: IIASRGARLS AAGIYGILKK IGRDATKDGE AQKSVIAMDG GLFEHYTQFS ESMKSSLKEL LGDEVSESVE VILSNDGSGV GAALLAASHS QYLELEDDSE 501: TS |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)