AT2G19770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : profilin 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes profilin 5, originally named profilin 4 (PRO4/PFN4). Low-molecular weight, actin monomer-binding protein that regulates the organization of actin cytoskeleton. Pollen-specific plant profilin present predominantly in mature pollen and growing pollen tubes. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
profilin 5 (PRF5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Profilin/allergen (InterPro:IPR002097), Profilin, plant (InterPro:IPR005455); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: profilin 4 (TAIR:AT4G29340.1); Has 915 Blast hits to 914 proteins in 244 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 138; Fungi - 121; Plants - 583; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 71 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:8519885..8521119 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14550.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 134 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSWQAYVDEH LMCDVGDGQG HHLTAAAIIG HDGSVWAQSA NFPQFKPQEI TDIMKDFDEP GHLAPTGMFL AGLKYMVIQG EPNAVIRGKK GAGGITIKKT 101: GQSMVFGLYE EPVTPGQCNM VVERLGDYLI EQGL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)