AT2G19410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.807 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : U-box domain-containing protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
U-box domain-containing protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: ubiquitin-protein ligase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, protein ubiquitination; LOCATED IN: ubiquitin ligase complex; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), U box domain (InterPro:IPR003613), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: U-box domain-containing protein kinase family protein (TAIR:AT5G57035.1); Has 118675 Blast hits to 117387 proteins in 4577 species: Archae - 133; Bacteria - 13900; Metazoa - 43121; Fungi - 9955; Plants - 33830; Viruses - 360; Other Eukaryotes - 17376 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:8404901..8409012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 90918.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 801 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVVMLTQEMS GGGGPKAEEG QLFVAVAVKG LIGDKLGGAG SRRAVRWAVD NLLPKADKFV MIHVIPTITS IPTPNILILM FTRMWVVTAG DRLPVEEVEE 101: SVVEMYVRDV KKEYETVFVP FLKMCKSTRS TKRYFRSRRT KGTGVPLTVL RYAPETCEVY IVCKDRITTK SMDPLINREP CTSPHAAATA HDFLRDWAAS 201: FHTLRSPTLP DPRQSTEAGT RRSASARELR FEALSLTCNK PKTPQSSKAS SATTPEIFRR RRGSDIPQLN YSDFDKTCTK PQSNVENIVS EHRDSDRSPP 301: ETSRKSKKVE IEEEVERLKN ELQSTVFKYK QACEELFSTQ NKVKMLSTEY LNESKRVNNA VEKEELQRNT AALEKERYMK AVKEVETAKA LLAREFCQRQ 401: IAEVNALRTY LEKKKVIDQL LGTDHRYRKY TIEEIVTATE GFSPEKVIGE GGYGKVYQCS LDSTPAAVKV VRLDTPEKKQ EFLKEVEVLS QLRHPHVVLL 501: LGACPENGCL VYEYLENGSL EEYIFHRKNK PPLPWFIRFR VIFEVACGLA FLHSSKPEPI VHRDLKPGNI LLNRNYVSKI ADVGLAKLVT DVAPDNVTMY 601: RNSVLAGTLH YIDPEYHRTG TIRPKSDLYA FGIIILQLLT ARNPSGIVPA VENAVKKGTL TEMLDKSVTD WPLAETEELA RIGLKCAEFR CRDRPDLKSE 701: VIPVLKRLVE TANSKVKKEG SNLRAPSHYF CPILREIMEE PEIAADGFTY ERKAILAWLE KHNISPVTRQ KLDHFKLTPN HTLRSAIRDW KSRVRFSNVV 801: V |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)