AT2G18600.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.935 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ubiquitin-conjugating enzyme family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ubiquitin-conjugating enzyme family protein; FUNCTIONS IN: ubiquitin-protein ligase activity, small conjugating protein ligase activity, acid-amino acid ligase activity, ATP binding; INVOLVED IN: regulation of protein metabolic process, protein modification process, post-translational protein modification; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like (InterPro:IPR016135), Ubiquitin-conjugating enzyme, E2 (InterPro:IPR000608), RUB1 conjugating enzyme Ubc12 (InterPro:IPR015580); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RUB1 conjugating enzyme 1 (TAIR:AT4G36800.2); Has 8339 Blast hits to 8336 proteins in 387 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 3796; Fungi - 1734; Plants - 1481; Viruses - 20; Other Eukaryotes - 1306 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:8073337..8074565 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21134.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 185 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIGLFKVKEK QREESQSNNG RGASTVKKQS AGELRLHKDI SELNLPKSCK ISFPNGKNDL MNFEVTIKPD EGYYLSGNFV FSFQVSNMYP HEAPKVKCKT 101: KVYHPNIDLE GNVCLNILRE DWKPVLNINT VIYGLFHLFT EPNYEDPLNH EAAAVLRDNP KTFEYNVRRA MMGGQVGQTS FPRCM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)