AT2G18130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : purple acid phosphatase 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
purple acid phosphatase 11 (PAP11); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity, acid phosphatase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: flower; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Metallophosphoesterase (InterPro:IPR004843), Purple acid phosphatase-like, N-terminal (InterPro:IPR008963); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: purple acid phosphatase 5 (TAIR:AT1G52940.1); Has 1762 Blast hits to 1746 proteins in 362 species: Archae - 3; Bacteria - 518; Metazoa - 182; Fungi - 81; Plants - 751; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 227 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:7879308..7883935 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50364.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 441 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELSHLALVC AAIAFSSIFV VSQAGITSTH ARVSEPSEEM SLETFPPPAG YNAPEQVHIT QGDNAGRAMI ISWVMPLNED GSNVVTYWIA SSDGSDNKNA 101: IATTSSYRYF NYTSGYLHHA TIKKLEYDPS KSRSRCSLHI RYYSDLGQTY ASNQTLYNYM SNPKGQAVLF VGDLSYADDH PNHDQRKWDS YGRFVEPSAA 201: YQPWSWAAGN YEIDYAQSIS ETQPFKPYKN RYHVPYKASQ STSPLWYSIK RASTYIIVLS SYSAYDKYTP QNSWLQDELK KVNRSETSWL IVLVHAPWYN 301: SNNYHYMEGE SMRVTFEPWF VENKVDIVFA GHVHAYERSK RISNIHYNIT DGMSTPVKDQ NAPIYITIGD GGNIEGIANS FTDPQPSYSA FREASFGHAL 401: LEIKNRTHAH YTWHRNKEDE AVIADSIWLK KRYYLPEEET A |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)