AT2G17280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphoglycerate mutase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Phosphoglycerate mutase family protein; FUNCTIONS IN: catalytic activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Histidine phosphatase superfamily, clade-1 (InterPro:IPR013078); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phosphoglycerate mutase family protein (TAIR:AT5G64460.8); Has 682 Blast hits to 682 proteins in 146 species: Archae - 0; Bacteria - 77; Metazoa - 0; Fungi - 321; Plants - 168; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 116 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:7513274..7514844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29891.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 271 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDNEGIGLYP LHRCKTIHLV RHAQGIHNVA GEKDHSAYSS EDYFDAHLTP LGWQQVDNLR NHVRAAQLLN KVELVIVSPM LRTIQTAVGA FGGEEDTNGA 101: DATPLMVANA GSSDRPAISS LNSPPFLAVE LCRETMGDHP CDRRRSVTEY KALFPAIDFS IIETDNDVLW KPSPRESLEE VAARGVEFIK WIWTRKEKEI 201: AIVSHSGFLH GLLSSFGKDC CDDLKKELSI HLSNCELRSM VIVDRGNLGT DSAETTNYPG KVPEGLDNPS G |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)