AT2G16930.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein L27 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein L27 family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: ribosome, intracellular; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L27 (InterPro:IPR001684), Ribosomal protein L27, conserved site (InterPro:IPR018261); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein L27 family protein (TAIR:AT5G15220.1); Has 7688 Blast hits to 7688 proteins in 2721 species: Archae - 0; Bacteria - 5395; Metazoa - 115; Fungi - 142; Plants - 116; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1920 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:7341492..7342118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 16679.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 154 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNFLNSAASI CRRVSLRELI TEVPAYTGSS ISDGSSSGLS LVLKRWATKK TAGSTKNGRD SNPKFLGVKK FGGESVIPGN IIVRQRGTRF HPGDYVGIGK 101: DHTLFALKEG RVRFEKSKIT GRKWIHVDPI GGHVLHPIYT KAAAAKSTKL NTAS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)