AT2G16120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : polyol/monosaccharide transporter 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
polyol/monosaccharide transporter 1 (PMT1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sugar transporter, conserved site (InterPro:IPR005829), Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), General substrate transporter (InterPro:IPR005828), Sugar/inositol transporter (InterPro:IPR003663), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: polyol/monosaccharide transporter 2 (TAIR:AT2G16130.1); Has 36841 Blast hits to 36098 proteins in 2329 species: Archae - 707; Bacteria - 19057; Metazoa - 5293; Fungi - 7417; Plants - 2614; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1751 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:6996727..6998441 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54761.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 511 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNSSGVEQGV VIAESEPPRG NRSRYAFACA ILASMTSIIL GYDIGVMSGA SIFIKDDLKL SDVQLEILMG ILNIYSLVGS GAAGRTSDWL GRRYTIVLAG 101: AFFFCGALLM GFATNYPFIM VGRFVAGIGV GYAMMIAPVY TAEVAPASSR GFLTSFPEIF INIGILLGYV SNYFFSKLPE HLGWRFMLGV GAVPSVFLAI 201: GVLAMPESPR WLVLQGRLGD AFKVLDKTSN TKEEAISRLD DIKRAVGIPD DMTDDVIVVP NKKSAGKGVW KDLLVRPTPS VRHILIACLG IHFAQQASGI 301: DAVVLYSPTI FSKAGLKSKN DQLLATVAVG VVKTLFIVVG TCVVDRFGRR ALLLTSMGGM FLSLTALGTS LTVINRNPGQ TLKWAIGLAV TTVMTFVATF 401: SIGAGPVTWV YCSEIFPVRL RAQGASLGVM LNRLMSGIIG MTFLSLSKGL TIGGAFLLFA GVAAAAWVFF FTFLPETRGI PLEEMETLFG SYTANKKNNS 501: MSKDNEVVDG Q |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)