AT2G15570.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Thioredoxin superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
chloroplast protein similar to prokaryotic thioredoxin. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATHM3; FUNCTIONS IN: enzyme activator activity; INVOLVED IN: positive regulation of catalytic activity; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Thioredoxin, core (InterPro:IPR015467), Thioredoxin domain (InterPro:IPR013766), Thioredoxin, conserved site (InterPro:IPR017937), Thioredoxin-like subdomain (InterPro:IPR006662), Thioredoxin-like (InterPro:IPR017936), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: thioredoxin M-type 4 (TAIR:AT3G15360.1); Has 16998 Blast hits to 16795 proteins in 2911 species: Archae - 264; Bacteria - 9868; Metazoa - 1437; Fungi - 798; Plants - 1429; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 3198 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:6791556..6792902 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19572.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 174 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAISSSSSSI CFNPTRFHTA RHISSPSRLF PVTSFSPRSL RFSDRRSLLS SSASRLRLSP LCVRDSRAAA EVTQRSWEDS VLKSETPVLV EFYTSWCGPC 101: RMVHRIIDEI AGDYAGKLNC YLLNADNDLP VAEEYEIKAV PVVLLFKNGE KRESIMGTMP KEFYISAIER VLNS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)