AT2G14890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : arabinogalactan protein 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
putative proline-rich protein (At2g14890) mRNA, complete | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
arabinogalactan protein 9 (AGP9); Has 285298 Blast hits to 106417 proteins in 3252 species: Archae - 851; Bacteria - 74147; Metazoa - 98199; Fungi - 38441; Plants - 27968; Viruses - 7387; Other Eukaryotes - 38305 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:6399679..6400755 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18416.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 191 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARSFAIAVI CIVLIAGVTG QAPTSPPTAT PAPPTPTTPP PAATPPPVSA PPPVTTSPPP VTTAPPPANP PPPVSSPPPA SPPPATPPPV ASPPPPVASP 101: PPATPPPVAT PPPAPLASPP AQVPAPAPTT KPDSPSPSPS SSPPLPSSDA PGPSTDSISP APSPTDVNDQ NGASKMVSSL VFGSVLVWFM I |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)