AT2G14540.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:cytosol 0.973 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : serpin 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
serpin 2 (SRP2); FUNCTIONS IN: serine-type endopeptidase inhibitor activity; INVOLVED IN: DNA repair, response to DNA damage stimulus; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: fruit; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protease inhibitor I4, serpin, plant (InterPro:IPR015554), Protease inhibitor I4, serpin (InterPro:IPR000215); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Serine protease inhibitor (SERPIN) family protein (TAIR:AT1G62170.1); Has 6246 Blast hits to 6203 proteins in 468 species: Archae - 66; Bacteria - 371; Metazoa - 4782; Fungi - 10; Plants - 340; Viruses - 461; Other Eukaryotes - 216 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:-:6197922..6199390 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 45889.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 5.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 407 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDSKRKNQEL STSETADPSL SKTNKKQKID MQEAMKNQNE VSLLLVGKVI SAVAKNSNCV FSPASINAVL TVTAANTDNK TLRSFILSFL KSSSTEETNA 101: IFHELASVVF KDGSETGGPK IAAVNGVWME QSLSCNPDWE DLFLNFFKAS FAKVDFRHKA EEVRLDVNTW ASRHTNDLIK EILPRGSVTS LTNWIYGNAL 201: YFKGAWEKAF DKSMTRDKPF HLLNGKSVSV PFMRSYEKQF IEAYDGFKVL RLPYRQGRDD TNREFSMYLY LPDKKGELDN LLERITSNPG FLDSHIPEYR 301: VDVGDFRIPK FKIEFGFEAS SVFNDFELNV SLHQKALIEI DEEGTEAAAA TTVVVVTGSC LWEPKKKIDF VADHPFLFLI REDKTGTLLF AGQIFDPSEL 401: SSALDRA |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)