AT2G14050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.631 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : minichromosome maintenance 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
minichromosome maintenance 9 (MCM9); FUNCTIONS IN: nucleoside-triphosphatase activity, DNA-dependent ATPase activity, DNA binding, nucleotide binding, ATP binding; INVOLVED IN: DNA-dependent DNA replication initiation, DNA replication; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: sperm cell, male gametophyte, pollen tube; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleic acid-binding, OB-fold (InterPro:IPR012340), Nucleic acid-binding, OB-fold-like (InterPro:IPR016027), ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), DNA-dependent ATPase MCM (InterPro:IPR001208); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein (TAIR:AT1G44900.2); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:5909240..5913817 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72467.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 646 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESPTQTSEH IESMTEFLVK HYPDQLREIS LSSDPKLHYP LFIEYAELVD DNPSLARQVF SDPEHYLRQF DDSAILAHKI ALEHMKKFEE KIGIEKRFIH 101: VRINTSGSPL ERSPETFPSI GRVRVKHRGI LMMLKGTVIR SGAVKMYEGE KMYRCRKCKH MFPIFPELES INSIVKPPFC PSQRSKACEG TNFDPVDDTV 201: TRHDYQEIKI QENTQVLGVG VIPRSILVVL KDDLVDNVKA GDDVVVSGIL TSKWSHDLKD VRCDLEPMLI ANHVRRTNEL KSEIDISDDL IEKFKNFWSH 301: FRDTPLKGRN AILRGICPQV FGLFTVKLAV ALTLIGGVQH VDASGTKVRG ESHLLLIGDP GTGKSQFLKF AAKLSNRAVI TTGLGSTSAG LTVTAVKDGG 401: EWMLEAGALV LADGGLCCID EFDSMREHDR ATIHEAMEQQ SISVAKAGLV TTLSTKTIVF GATNPKGQYD PDQSLSVNTA LSGPLLSRFD IVLVLLDTKN 501: PEWDAVVSSH ILAEVQIEQD REVDDLTTIW PLPMLQRYIQ FVKKNFRPVL SKEAEEIISS YYRLQRRSST HNAARTTVRM LESLIRLAQA HARLMFRNEV 601: TRLDAITAIL CIESSMTISA IVDSMGNALH SNFSEEPDQE CILFRH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)