AT2G03770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; FUNCTIONS IN: sulfotransferase activity; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sulfotransferase domain (InterPro:IPR000863); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sulphotransferase 12 (TAIR:AT2G03760.1); Has 2856 Blast hits to 2814 proteins in 190 species: Archae - 0; Bacteria - 223; Metazoa - 1695; Fungi - 1; Plants - 540; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 397 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:1150871..1151845 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37719.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 324 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTKSETTLSK LLVESELVQE CEELLSSLPR DRSVFAEYLY QYQGFWYPPN LLEGVLYSQK HFQARDSDIV LASIPKSGTT WLKSLVFALI HRQEFQTPLV 101: SHPLLDNNPH TLVTFIEGFH LHTQDTSPRI FSTHIPVGSL PESVKDSSCK VVYCCRNPKD AFVSLWHFMK NLIVKEMVGC TMEEMVRFFC RGSSIYGPFW 201: DHVLQYWKES RENPKKVMFV MYEEMREQPQ EWVMRIAEFL GYSFTEEEIE NGVLEDIIKL CSLENLSKLE VNEKGKLLNG METKAFFRKG EIGGWRDTLT 301: PLLAEEIDKT TKEKLIGSDF RFFC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)