AT2G02380.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.977 What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : glutathione S-transferase (class zeta) 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes glutathione transferase belonging to the zeta class of GSTs. Naming convention according to Wagner et al. (2002). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glutathione S-transferase (class zeta) 2 (GSTZ2); FUNCTIONS IN: glutathione transferase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: toxin catabolic process; LOCATED IN: cytoplasm; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Maleylacetoacetate isomerase (InterPro:IPR005955), Glutathione S-transferase, C-terminal (InterPro:IPR004046), Glutathione S-transferase/chloride channel, C-terminal (InterPro:IPR017933), Glutathione S-transferase, N-terminal (InterPro:IPR004045), Glutathione S-transferase, C-terminal-like (InterPro:IPR010987), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glutathione S-transferase zeta 1 (TAIR:AT2G02390.1); Has 17209 Blast hits to 17183 proteins in 1466 species: Archae - 0; Bacteria - 9323; Metazoa - 2194; Fungi - 581; Plants - 2162; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2949 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:626878..628569 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25353.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 223 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSYVTDFYQA KLKLYSYWRS SCAHRVRIAL TLKGLDYEYI PVNLLKGDQS DSDFKKINPM GTVPALVDGD VVINDSFAII MYLDDKYPEP PLLPSDYHKR 101: AVNYQATSIV MSGIQPHQNM ALFRYLEDKI NAEEKTAWIT NAITKGFTAL EKLLVSCAGK YATGDEVYLA DLFLAPQIHA AFNRFHINME PFPTLARFYE 201: SYNELPAFQN AVPEKQPDTP STI |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)