AT2G02340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.497 mitochondrion 0.458 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phloem protein 2-B8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
phloem protein 2-B8 (PP2-B8); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: F-box domain, cyclin-like (InterPro:IPR001810), F-box domain, Skp2-like (InterPro:IPR022364); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phloem protein 2-B7 (TAIR:AT2G02320.1); Has 560 Blast hits to 546 proteins in 38 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 560; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:616088..617274 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35240.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 305 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTKTRCMHEH FRKIVQRVKK TLRLSASDKS HGVAELDDLP EECVSIIVSF TSPQDACVLA SVSKTFASAV KSDIVWEKFI PPEYESLISQ SRAFKFLSKK 101: ELYFALCDKS VLIDDGKKSL WIEKANAKRC IMISAMNLAI AWGNSPQSWR WIPDPQARFE TVAELLEVCL FEIRGRINSR VISPKTRYSA YIVYKKLNIC 201: YGFENVAVEV VVGVVGQDLE ESCRRYICFD ETMDEQFRRR DRGKNLVKPE RRKDGWMEIK IGEFFNEGGL LNDDEIEMVA LEAKQRHWKR GLIIQGIEIR 301: PTNIR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)