AT1G80660.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.856 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : H(+)-ATPase 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
H(+)-ATPase 9 (HA9); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, P-type, ATPase-associated domain (InterPro:IPR008250), ATPase, P-type cation-transporter, N-terminal (InterPro:IPR004014), Haloacid dehalogenase-like hydrolase (InterPro:IPR005834), ATPase, P-type, H+ transporting proton pump (InterPro:IPR000695), ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter (InterPro:IPR001757), ATPase, P-type, plasma-membrane proton-efflux (InterPro:IPR006534), ATPase, P-type phosphorylation site (InterPro:IPR018303); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: H(+)-ATPase 6 (TAIR:AT2G07560.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:30316227..30319948 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 104130.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 945 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAGNKDSSWD DIKNEGIDLE KIPIEEVLTQ LRCTREGLTS DEGQTRLEIF GPNKLEEKKE NKVLKFLGFM WNPLSWVMEL AAIMAIALAN GGGRPPDWQD 101: FVGITVLLII NSTISFIEEN NAGNAAAALM AGLAPKTKVL RDGKWSEQEA AILVPGDIIS IKLGDIVPAD GRLLDGDPLK IDQSALTGES LPVTKHPGQE 201: VYSGSTCKQG ELEAVVIATG VHTFFGKAAH LVDSTNQEGH FQKVLTAIGN FCICSIAIGM LIEIVVMYPI QKRAYRDGID NLLVLLIGGI PIAMPTVLSV 301: TMAIGSHRLS QQGAITKRMT AIEEMAGMDV LCSDKTGTLT LNKLTVDKSM VEVFVKDLDK DQLLVNAARA SRVENQDAID ACIVGMLGDP REAREGITEV 401: HFFPFNPVDK RTAITYIDAN GNWHRVSKGA PEQDASKRAH DIIDKFADRG LRSLAVGRQT VSEKDKNSPG EPWQFLGLLP LFDPPRHDSA ETIRRALDLG 501: VNVKMITGDQ LAIGKETGRR LGMGTNMYPS SALLGQDKDE SIASLPVDEL IEKADGFAGV FPEHKYEIVK RLQEMKHICG MTGDGVNDAP ALKRADIGIA 601: VADATDAARS ASDIVLTEPG LSVIVSAVLT SRAIFQRMKN YTIYAVSITI RIVMGFMLLA LIWKFDFSPF MVLIVAILND GTIMTISKDR VKPSPLPDSW 701: KLKEIFATGV VLGTYLAVMT VVFFWAAEST DFFSAKFGVR SISGNPHELT AAVYLQVSIV SQALIFVTRS RSWSYVERPG FWLISAFFMA QLIATLIAVY 801: ANWNFARIRG IGWGWAGVIW LYSIVFYIPL DILKFIIRYS LSGRAWDNVI ENKTAFTSKK DYGKGEREAQ WAQAQRTLHG LQPAQTSDMF NDKSTYRELS 901: EIADQAKRRA EVARLRERHT LKGHVESVVK QKGLDIEAIQ QHYTL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)