AT1G80460.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Actin-like ATPase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein similar to glycerol kinase, which converts glycerol to glycerol 3-phosphate and performs a rate-limiting step in glycerol metabolism. This gene is required for both general and specific resistance against bacteria and fungi. Arabidopsis thaliana glycerol kinase (GLR1) mRNA.Involved in flagellin-induced non-host resistance to Pseudomonas. Coronatine partially suppresses flagellin-induced expression of NHO1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
nonhost resistance to P. s. phaseolicola 1 (NHO1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carbohydrate kinase, FGGY, conserved site (InterPro:IPR018483), Glycerol kinase (InterPro:IPR005999), Carbohydrate kinase, FGGY (InterPro:IPR000577), Carbohydrate kinase, FGGY, N-terminal (InterPro:IPR018484), Carbohydrate kinase, FGGY, C-terminal (InterPro:IPR018485); Has 17039 Blast hits to 17024 proteins in 2439 species: Archae - 160; Bacteria - 12245; Metazoa - 663; Fungi - 209; Plants - 115; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3647 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:30246960..30249055 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56439.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 522 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKENGFIGS IDQGTTSTRF IIYDHDARPV ASHQVEFTQF YPEAGWVEHD PMEILESVKV CIAKALDKAT ADGHNVDGGL KAIGLTDQRE TTVVWSKSTG 101: LPLHKAIVWM DARTSSICRR LEKELSGGRS HFVESCGLPI STYFSAMKLL WLMENVDDVK DAIKKGDAIF GTIDTWLIWN MTGGINGGLH VTDVTNASRT 201: MLMNLKTLSW DQDTLKTLGI PAEILPKIVS NSEVIGEICK GWPIPGIKIA GCLGDQHAAM LGQACRKGEA KSTYGTGAFI LLNTGEVPIK SGHGLLTTLA 301: YKLGPQAQTN YALEGSIAIA GAAVQWLRDS LGIIKSASEI EDLAAMVDST GGVYFVPAFN GLFAPWWRED ARGVCIGITR FTNKSHIARA VLESMCFQVK 401: DVLDSMNKDA GEKGSLNNGK GEFLLRVDGG ATANNLLMQI QADLMGSPVV RPVDIETTAL GAAYAAGLAV GFWKEADIFE SGEKAKNSKV FRPAMEEGIR 501: KKKVASWCKA VERTFDLADL SI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)