AT1G79550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphoglycerate kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes cytosolic phosphoglycerate kinase (PGK). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
phosphoglycerate kinase (PGK); FUNCTIONS IN: phosphoglycerate kinase activity; INVOLVED IN: glycolysis; LOCATED IN: cytosol, apoplast, plasma membrane, nucleus, membrane; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphoglycerate kinase, N-terminal (InterPro:IPR015824), Phosphoglycerate kinase (InterPro:IPR001576), Phosphoglycerate kinase, C-terminal (InterPro:IPR015901); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phosphoglycerate kinase family protein (TAIR:AT1G56190.1); Has 10844 Blast hits to 10818 proteins in 3011 species: Archae - 254; Bacteria - 5218; Metazoa - 451; Fungi - 193; Plants - 517; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4211 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:29924347..29926295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42134.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 401 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATKRSVGTL KEADLKGKSV FVRVDLNVPL DDNSNITDDT RIRAAVPTIK YLMGNGSRVV LCSHLGRPKG VTPKYSLKPL VPRLSELLGV EVVMANDSIG 101: EEVQKLVAGL PEGGVLLLEN VRFYAEEEKN DPEFAKKLAA LADVYVNDAF GTAHRAHAST EGVAKFLKPS VAGFLMQKEL DYLVGAVANP KKPFAAIVGG 201: SKVSTKIGVI ESLLNTVDIL LLGGGMIFTF YKAQGLSVGS SLVEEDKLDL AKSLMEKAKA KGVSLLLPTD VVIADKFAPD ANSKIVPATA IPDGWMGLDI 301: GPDSIKTFSE ALDTTKTIIW NGPMGVFEFD KFAAGTEAVA KQLAELSGKG VTTIIGGGDS VAAVEKVGLA DKMSHISTGG GASLELLEGK PLPGVLALDE 401: A |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)