AT1G79010.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Alpha-helical ferredoxin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Alpha-helical ferredoxin; FUNCTIONS IN: NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity, metal ion binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: mitochondrion, mitochondrial respiratory chain complex I, respiratory chain complex I; EXPRESSED IN: male gametophyte, pollen tube; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 4Fe-4S binding domain (InterPro:IPR001450), NADH-quinone oxidoreductase, chain I (InterPro:IPR010226), 4Fe-4S ferredoxin, iron-sulpur binding domain (InterPro:IPR017896), 4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site (InterPro:IPR017900), Alpha-helical ferredoxin (InterPro:IPR009051); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Alpha-helical ferredoxin (TAIR:AT1G16700.1); Has 11535 Blast hits to 10912 proteins in 2421 species: Archae - 1438; Bacteria - 6995; Metazoa - 154; Fungi - 106; Plants - 790; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 2051 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:29725138..29726933 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25504.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 222 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASILARRSL NTLRARHLVL SGQALQGSHL SRLQSRGISY GSNKDDEEAE QLSKEISKDW NTVFERSINT LFLTEMVRGL SLTLKYFFDP KVTINYPFEK 101: GPLSPRFRGE HALRRYPTGE ERCIACKLCE AVCPAQAITI EAEEREDGSR RTTRYDIDMT KCIYCGFCQE ACPVDAIVEG PNFEFATETH EELLYDKEKL 201: LENGDRWETE IAENLRSESL YR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)