AT1G77100.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.459 plasma membrane 0.374 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Peroxidase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Peroxidase superfamily protein; FUNCTIONS IN: peroxidase activity, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction, response to oxidative stress; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem peroxidase (InterPro:IPR010255), Plant peroxidase (InterPro:IPR000823), Peroxidase, active site (InterPro:IPR019794), Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial (InterPro:IPR002016); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Peroxidase superfamily protein (TAIR:AT4G25980.1); Has 4380 Blast hits to 4357 proteins in 274 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1; Fungi - 206; Plants - 4128; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 45 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:28965772..28967066 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36882.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 336 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSRRIREDIS IRLFDPKMIT IALFLVLLYF HDQLGYSAAQ LQFGFYSETC PSAESIVRDV VQQAVTNDPG KAAVLLRLQF HDCFVEGCDG SILIKHGGND 101: DERFAAGNAG VAGFDVIDEA KSELERFCPG VVSCADIVAL AARDAIAEAK GPFYEVPTGR RDGLIANVDH AKNLPDVQDS INTLKSKFRE KGLSDQDLVL 201: LSAGAHTIGT TACFFVIPRL DAQDPTINPE FFQILRSKCP QGGDVNVRIP LDWDSQFVFD NQIFQNIKNG RGVILSDSVL YQDNNMKKII DSYLETNQSS 301: KANFAADFTK AMIKMGAIGV KIGAEGEIRR LCSATN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)