AT1G74710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ADC synthase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with isochorismate synthase activity. Mutants fail to accumulate salicylic acid. Its function may be redundant with that of ICS2 (AT1G18870). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ENHANCED DISEASE SUSCEPTIBILITY TO ERYSIPHE ORONTII 16 (EDS16); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Chorismate binding, C-terminal (InterPro:IPR015890), ADC synthase (InterPro:IPR005801), Isochorismate synthase (InterPro:IPR004561); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: isochorismate synthase 2 (TAIR:AT1G18870.1); Has 14352 Blast hits to 14347 proteins in 2540 species: Archae - 246; Bacteria - 10586; Metazoa - 5; Fungi - 256; Plants - 213; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3046 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:28070391..28073898 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 62578.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 569 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASLQFSSQF LGSNTKTHSS IISISRSYSP TPFTRFSRKK YESCSMSMNG CDGDFKTPLG TVETRTMTAV LSPAAATERL ISAVSELKSQ PPSFSSGVVR 101: LQVPIDQQIG AIDWLQAQNE IQPRCFFSRR SDVGRPDLLL DLANENGNGN GNGTVSSDRN LVSVAGIGSA VFFRDLDPFS HDDWRSIRRF LSSTSPLIRA 201: YGGMRFDPNG KIAVEWEPFG AFYFSVPQVE FNEFGGSSML AATIAWDDEL SWTLENAIEA LQETMLQVSS VVMKLRNRSL GVSVLSKNHV PTKGAYFPAV 301: EKALEMINQK SSPLNKVVLA RNSRIITDTD IDPIAWLAQL QREGHDAYQF CLQPPGAPAF IGNTPERLFQ RTQLGVCSEA LAATRPRAAS SARDMEIERD 401: LLTSPKDDLE FSIVRENIRE KLNGICDRVV VKPQKTVRKL ARVQHLYSQL AGRLTKEDDE YKILAALHPT PAVCGLPAEE ARLLIKEIES FDRGMYAGPI 501: GFFGGEESEF AVGIRSALVE KGLGALIYAG TGIVAGSDPS SEWNELDLKI SQFTKSIEYE ATTSLQAIN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)