AT1G74660.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : mini zinc finger 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Constitutive overexpression of MIF1 caused dramatic developmental defects, seedlings were non-responsive to gibberellin (GA) for cell elongation, hypersensitive to the GA synthesis inhibitor paclobutrazol (PAC) and abscisic acid (ABA), and hyposensitive to auxin, brassinosteroid and cytokinin, but normally responsive to ethylene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
mini zinc finger 1 (MIF1); FUNCTIONS IN: DNA binding, sequence-specific DNA binding transcription factor activity; INVOLVED IN: in 7 processes; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 8 plant structures; EXPRESSED DURING: seedling growth, 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain (InterPro:IPR006456); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: mini zinc finger (TAIR:AT1G18835.1); Has 423 Blast hits to 423 proteins in 28 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 423; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:28047742..28048050 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 11213.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 102 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMKKRQMVIK QRSRNSNTSS SWTTTSSSSS SSEISNVRYV ECQKNHAANI GGYAVDGCRE FMAAGVEGTV DALRCAACGC HRNFHRKEVD TEVVCEYSPP 101: NA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)