AT1G74420.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.859 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : fucosyltransferase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Predicted fucosyltransferase, based on similarity to FUT1, but not functionally redundantwith FUT1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
fucosyltransferase 3 (FUT3); FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring glycosyl groups, fucosyltransferase activity; INVOLVED IN: cell wall biogenesis; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Xyloglucan fucosyltransferase (InterPro:IPR004938); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fucosyltransferase 1 (TAIR:AT2G03220.1); Has 325 Blast hits to 317 proteins in 15 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 325; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:27968021..27969799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58992.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 521 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKRGKKNSDA GDRLTNSDTR TGSSELNAMM KPSLSSMKTM GLLLAVLMVA SVMFSLSVVL RDPPSDDVIE TEAASRVLQS RLHQDGGLSE KKAQLGNINL 101: VPSFDKESCL SRYEASLYRK ESPFKQSSYL DYRLQRYEDL HRRCGPFTRS YNLTLDKLKS GDRSDGEVSG CRYVIWLNSN GDLGNRMLSL ASAFLYALLT 201: NRFLLVELGV DMADLFCEPF PNTTWFLPPE FPLNSHFNEQ SLLRNSGNPM VAYRHVVRDS SDQQKLFFCE DSQVLLEETP WLILKADSFF LPSLFSVSSF 301: KQELQMLFPE KDTAFHFLSQ YLFHPTNVVW GLITRYYNAY LAKADQRIGI YIGVSESGNE QFQHLIDQIL ACGTRHKLLP EVDKQRNLPS SQVLNRKSKA 401: VFISSSSPGY FKSIRDVYWE NPTVMGEIIS VHKPSYKDYQ KTPRNMESKR AWAEIYLLSC SDALVVTGLW SSLVEVAHGL GGLKPWVLNK AENGTAHEPY 501: CVKARSIEPC SQATLFHGCK D |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)