AT1G74130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (mitochondrial marker)
Arabidopsis cell culture (plastidal marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Rhomboid-related intramembrane serine protease family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Rhomboid-related intramembrane serine protease family protein; FUNCTIONS IN: serine-type endopeptidase activity; LOCATED IN: integral to membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase S54, rhomboid (InterPro:IPR002610); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Rhomboid-related intramembrane serine protease family protein (TAIR:AT1G74140.5); Has 1475 Blast hits to 1475 proteins in 563 species: Archae - 48; Bacteria - 988; Metazoa - 11; Fungi - 87; Plants - 67; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 274 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:27873687..27875897 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35453.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 322 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MHAIFCRRVA VGCSSPQLTK LVTKQASQSR HSLSHLLPFD LSSRFVPPYV VSRSARVHGF FAGKLGNTNL KLKFGNVMES RAGFFSSELP SHGFESGGFT 101: GFQKRGWKSW INGANGVVFG LVIANAAVFT MWRVLGKDNM WMVKNFMLSR YSFMTGRIHT LITSGFSHVG ATHIILNMMG LCYFGARIAR SFGPRYLLKL 201: YFAGALGGSV FFLSSHALSV ISLKGQRVVP KDQLKVPIGK LGANGPVYAI TLLDMLLYPK VTTYFGLMLR VPVFAGIYSL GLNIIKMLEG KNNNTLTSLD 301: QLGGVVVAVI AWARIRKGRF CY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)