AT1G73910.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : actin-related proteins 4A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a gene similar to actin-related proteins in other organisms. Member of nuclear ARP family of genes. Component of chromatin remodeling complexes, involved in chromatin-mediated gene regulation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
actin-related proteins 4A (ARP4A); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Actin/actin-like (InterPro:IPR004000); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: actin-related protein 4 (TAIR:AT1G18450.1); Has 8295 Blast hits to 8286 proteins in 1571 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 4071; Fungi - 1608; Plants - 922; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1688 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:27789293..27790187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15993.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 145 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MYGGDEVSAI VVDLGSHTCK AGYAGEDAPK AVFPSVVGAI DGNGMDIDDA ANTTEDAKES DKEKGKRKLY TGSQALNFRR DQMEILSPTK DGIVTDWDMV 101: DNVWDHAFRN CLMIDPTEHP MLLAEPPLNS QQQREKSGFS TFYRC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)