AT1G73880.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.755 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-glucosyl transferase 89B1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
UDP-glucosyl transferase 89B1 (UGT89B1); FUNCTIONS IN: in 7 functions; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-Glycosyltransferase superfamily protein (TAIR:AT1G51210.1); Has 6052 Blast hits to 5982 proteins in 308 species: Archae - 0; Bacteria - 87; Metazoa - 884; Fungi - 31; Plants - 4945; Viruses - 61; Other Eukaryotes - 44 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:27785143..27786564 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52108.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 473 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKVNEENNKP TKTHVLIFPF PAQGHMIPLL DFTHRLALRG GAALKITVLV TPKNLPFLSP LLSAVVNIEP LILPFPSHPS IPSGVENVQD LPPSGFPLMI 101: HALGNLHAPL ISWITSHPSP PVAIVSDFFL GWTKNLGIPR FDFSPSAAIT CCILNTLWIE MPTKINEDDD NEILHFPKIP NCPKYRFDQI SSLYRSYVHG 201: DPAWEFIRDS FRDNVASWGL VVNSFTAMEG VYLEHLKREM GHDRVWAVGP IIPLSGDNRG GPTSVSVDHV MSWLDAREDN HVVYVCFGSQ VVLTKEQTLA 301: LASGLEKSGV HFIWAVKEPV EKDSTRGNIL DGFDDRVAGR GLVIRGWAPQ VAVLRHRAVG AFLTHCGWNS VVEAVVAGVL MLTWPMRADQ YTDASLVVDE 401: LKVGVRACEG PDTVPDPDEL ARVFADSVTG NQTERIKAVE LRKAALDAIQ ERGSSVNDLD GFIQHVVSLG LNK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)