AT1G73680.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.634 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha dioxygenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an alpha dioxygenase. Recombinant protein catalyzes the conversion of a wide range of fatty acids into 2(R)-hydroperoxy derivatives. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
alpha dioxygenase (ALPHA DOX2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem peroxidase (InterPro:IPR010255), Haem peroxidase, animal (InterPro:IPR002007); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Peroxidase superfamily protein (TAIR:AT3G01420.1); Has 1634 Blast hits to 1495 proteins in 223 species: Archae - 0; Bacteria - 102; Metazoa - 1237; Fungi - 165; Plants - 68; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 59 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:27704221..27707417 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72461.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 631 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGFSPSSSWF LHPQLHHVVS KMSYFDAFLF YIVHLVDKLG LWHRFPVLLG VAYLGLRRHL HQRYNLVHVG PINGQGYDTD EFCYRTADGK CNHPSDNTIG 101: SQGSFIGRNM PPSTSQYGIL DPHPSVVATK LLARKRFIDN GDQFNVIACS WIQFMIHDWV DHLEDTHQIE LEAPEEVASG CPLKSFKFLR TKKVPTDDHH 201: KSGAVNTRTP WWDGSVIYGN DETGMRRVRV FKDGKLKISG DGLLERDERG VPISGDIRNS WSGFSLLQAL FVKEHNSVCD MLKERYPDFD DEKLYRTARL 301: VTAAVIAKVH TIDWTIELLK TDTLTAGMRI NWYGFFGKKV KDMVGARFGP LFSGLVGLKK PNDHGVPYSL TEEFVSVYRM HCLLPETLIL RDMNSENVDK 401: ENPAIEREIP MTELIGKKAG EKASKLGFEQ LLVSMGHQSC GALTLWNYPN WMRNLVAQDI DGEDRPHLID MAALEIYRDR ERGVPRYNEF RKNLLMSPIS 501: KWEELTDDEE AIKVLREVYE DDIEKLDLNV GLHAEKKIKG FAISETAFFI FLLVASRRLE ADRFFTTNFN EKTYTKEGLE WVNTTETLKD VIDRHFPRLT 601: DQWMRCSSAF SVWGSDPNPK NWVPLYLRSA P |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)