AT1G73020.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.794 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
unknown protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF590 (InterPro:IPR007632); Has 1198 Blast hits to 1128 proteins in 154 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 809; Fungi - 158; Plants - 25; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 206 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:27469714..27473181 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 76809.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 665 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNGSNGEERV VHEVAMVVPK RVLEEEEGDC VEVLVTELRK KGMVVDRVVG LAHEFLKVAA PSEILGNAAA ELHIRKPTRL GIDLPFEMQG SEAFIRQPDG 101: LLFSWFERFR CYQHLIYGIV NSGGHDVTLK LDGREFCWTA GESLLRRLES EGVIKQMFPL HDELKRKELL QNWALNWWNC TNQPIDQIYS YFGAKIGVYF 201: SFLGMYTQWL IFPALLGFIV QMVDFGSLQF LALPSFFVGT ILWAALFLQF WKRKNAALLA RWQINCLVGP SQGYRFLGME WSSLPFPKEL IKNLGNERAK 301: EKEAYQRYEW FAYRKRFRND VLVIMSIICL QLPFELAYAH IFEIITSDII KYVLTAIYLL IIQYLTRLGG KVSVKLINRE INESVEYRAN SLIYKVFGLY 401: FMQTYIGIFY HVLLHRNFMT LRQVLIQRLI ISQVFWTLMD GSLPYLKYSY RKYRARTKKK MEDGSSTGKI QIASRVEKEY FKPTYSASIG VELEDGLFDD 501: SLELALQFGM IMMFACAFPL AFALAAVSNV MEIRTNALKL LVTLRRPLPR AAATIGAWLN IWQFLVVMSI CTNSALLVCL YDQEGKWKIE PGLAAILIME 601: HVLLLLKFGL SRLVPEEPAW VRASRVKNVT QAQDMYCKQL LRSISGEFNS LTKPEQEQQQ DSERF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)