AT1G73010.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.765 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphate starvation-induced gene 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
phosphate starvation-induced gene 2 (PS2); FUNCTIONS IN: phosphatase activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridoxal phosphate phosphatase, PHOSPHO2 (InterPro:IPR016965), HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB, PSPase-like (InterPro:IPR006383), Pyridoxal phosphate phosphatase-related (InterPro:IPR006384); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pyridoxal phosphate phosphatase-related protein (TAIR:AT1G17710.1); Has 357 Blast hits to 345 proteins in 104 species: Archae - 0; Bacteria - 14; Metazoa - 174; Fungi - 18; Plants - 106; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 45 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:27464780..27466180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33517.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 295 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAYNSNSNNN NNNIVVVFDF DKTIIDVDSD NWVIDELGFT DLFNQLLPTM PWNTLMDRMM KELHDQGKTI EEIKQVLRTI PIHPRVVPAI KSAHDLGCEL 101: RIVSDANMFF IETIVEHLGI SELFSEINSN PGYVDERGTL KISPYHDFTK SPHSCSCGTC PPNMCKGLII ERIQQSLAKE GKKKMIYLGD GAGDYCPSLK 201: LNTEDYVMPR KNFPVWDLIS QNPMLIKAAI REWTDGQSME MILIGTIEEI RLEEEKEKML TSAENNCKMQ TISIGINNVH HEPILPRALR VSQSS |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)