AT1G72660.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.981 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; FUNCTIONS IN: GTP binding; LOCATED IN: intracellular; EXPRESSED IN: root, flower; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Small GTP-binding protein (InterPro:IPR005225), TGS (InterPro:IPR004095), GTP1/OBG (InterPro:IPR006073), GTP1/OBG, conserved site (InterPro:IPR006074), GTP-binding protein, HSR1-related (InterPro:IPR002917); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: developmentally regulated G-protein 1 (TAIR:AT1G17470.2); Has 20231 Blast hits to 20218 proteins in 2950 species: Archae - 768; Bacteria - 13174; Metazoa - 858; Fungi - 589; Plants - 384; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4458 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:27354161..27356543 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44805.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 399 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGIVERIKEI EAEMARTQKN KATEYHLGQL KAKIAKLRTQ LLEPPKGSSG GGDGFEVTKY GHGRVALIGF PSVGKSTLLT MLTGTHSEAA SYEFTTLTCI 101: PGVIHYNDTK IQLLDLPGII EGASEGKGRG RQVIAVAKSS DLVLMVLDAS KSEGHRQILT KELEAVGLRL NKRPPQIYFK KKKTGGISFN TTTPLTRIDE 201: KLCYQILHEY KIHNAEVLFR EDATVDDFID VVEGNRKYIK CVYVYNKIDV VGIDDVDRLA RQPNSIVISC NLKLNLDRLL ARMWDEMGLV RVYSKPQSQQ 301: PDFDEPFVLS ADRGGCTVED FCNQVHRTLV KDMKYALVWG TSARHYPQHC GLFHHLEDED VVQIVKKKVR EEGGRGRFKS HSNAPARIAD REKKAPLKQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)