AT1G71960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP-binding casette family G25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a plasma membrane localized ABC transporter involved in abscisic acid transport and responses. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATP-binding casette family G25 (ABCG25); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), ABC transporter-like (InterPro:IPR003439), ABC-2 type transporter (InterPro:IPR013525); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATP-binding cassette 14 (TAIR:AT1G31770.1); Has 400795 Blast hits to 363827 proteins in 4147 species: Archae - 6947; Bacteria - 316897; Metazoa - 8938; Fungi - 6866; Plants - 5594; Viruses - 13; Other Eukaryotes - 55540 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:27082587..27088163 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72907.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 662 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSAFDGVENQ MNGPDSSPRL SQDPREPRSL LSSSCFPITL KFVDVCYRVK IHGMSNDSCN IKKLLGLKQK PSDETRSTEE RTILSGVTGM ISPGEFMAVL 101: GPSGSGKSTL LNAVAGRLHG SNLTGKILIN DGKITKQTLK RTGFVAQDDL LYPHLTVRET LVFVALLRLP RSLTRDVKLR AAESVISELG LTKCENTVVG 201: NTFIRGISGG ERKRVSIAHE LLINPSLLVL DEPTSGLDAT AALRLVQTLA GLAHGKGKTV VTSIHQPSSR VFQMFDTVLL LSEGKCLFVG KGRDAMAYFE 301: SVGFSPAFPM NPADFLLDLA NGVCQTDGVT EREKPNVRQT LVTAYDTLLA PQVKTCIEVS HFPQDNARFV KTRVNGGGIT TCIATWFSQL CILLHRLLKE 401: RRHESFDLLR IFQVVAASIL CGLMWWHSDY RDVHDRLGLL FFISIFWGVL PSFNAVFTFP QERAIFTRER ASGMYTLSSY FMAHVLGSLS MELVLPASFL 501: TFTYWMVYLR PGIVPFLLTL SVLLLYVLAS QGLGLALGAA IMDAKKASTI VTVTMLAFVL TGGYYVNKVP SGMVWMKYVS TTFYCYRLLV AIQYGSGEEI 601: LRMLGCDSKG KQGASAATSA GCRFVEEEVI GDVGMWTSVG VLFLMFFGYR VLAYLALRRI KH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)