AT1G71330.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.508 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : non-intrinsic ABC protein 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of NAP subfamily | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
non-intrinsic ABC protein 5 (NAP5); FUNCTIONS IN: ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances, transporter activity; INVOLVED IN: transport, transmembrane transport; LOCATED IN: integral to membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ABC transporter-like (InterPro:IPR003439), ABC transporter, transmembrane domain, type 1 (InterPro:IPR011527), ABC transporter integral membrane type 1 (InterPro:IPR017940); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: multidrug resistance-associated protein 3 (TAIR:AT3G13080.2); Has 184887 Blast hits to 178374 proteins in 3653 species: Archae - 2910; Bacteria - 144984; Metazoa - 5700; Fungi - 3947; Plants - 2517; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 24826 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:26884014..26885169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35812.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 324 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDRERYDKVI EACSLSKDLE ILSFGDQTVI GERGINLSGG QKQRIHIARA LYQDADIYLF DDPFSAVDAH TGSHLFKEAL RGLLCSKSVI YVTHQVEFLP 101: SADLTLVMKD GRISQAGKYN DILISGTDFR ELIGAHQESL AVVGSADASS VSENSALDEE NGVVRDDIGF DGKQESQDLK NDKLDSGEPQ RQFVQEEERA 201: KGSVALDVYW KYITLAYGGA LVPFILLGQI LFQLLQIGSN YWMAWATPIS EDVQAPVKLS TLMVVYVALA FGSSLCILVR ATLLVTAGYK TATELFHKMH 301: HCIFRSPMSF KIAKTCSKTC IYSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)