AT1G70830.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : MLP-like protein 28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MLP-like protein 28 (MLP28); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: response to biotic stimulus, defense response; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Bet v I allergen (InterPro:IPR000916); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MLP-like protein 34 (TAIR:AT1G70850.3); Has 829 Blast hits to 443 proteins in 50 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 2; Plants - 827; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:26710203..26711395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37616.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 335 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADVATKHPM EDEVKKTEAS SLVGKLETDV EIKASADKFH HMFAGKPHHV SKASPGNIQG CDLHEGDWGT VGSIVFWNYV HDGEAKVAKE RIEAVEPDKN 101: LITFRVIEGD LMKEYKSFLL TIQVTPKPGG PGSIVHWHLE YEKISEEVAH PETLLQFCVE VSKEIDEHLL AEEEEVKTPE TPSLVGKLET DVEIKASAEK 201: FHHMFAGKPH HVSKASPGNI QGCDLHEGDW GQVGSIVFWN YVHDREAKVA KERIEAVEPN KNLITFRVID GDLMKEYKSF LLTIQVTPKL GGPGSIVHWH 301: LEYEKISEEV AHPETLLQFC VEVSKEIDEH LLAEE |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)