AT1G70560.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.936 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : tryptophan aminotransferase of Arabidopsis 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
TAA1 is involved in the shade-induced production of indole-3-pyruvate (IPA), a precursor to IAA, a biologically active auxin. It is also involved in regulating many aspects of plant growth and development from embryogenesis to flower formation and plays a role in ethylene-mediated signaling. This enzyme can catalyze the formation of IPA from L-tryptophan. Though L-Trp is expected to be the preferred substrate in vivo, TAA1 also acts as an aminotransferase using L-Phe, L-Tyr, L-Leu, L-Ala, L-Met, and L-Gln. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
tryptophan aminotransferase of Arabidopsis 1 (TAA1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421), Allinase, C-terminal (InterPro:IPR006948), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2 (InterPro:IPR015422); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: tryptophan aminotransferase related 1 (TAIR:AT1G23320.1); Has 469 Blast hits to 469 proteins in 134 species: Archae - 44; Bacteria - 178; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 199; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 48 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:26604894..26607319 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44803.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 391 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVKLENSRKP EKISNKNIPM SDFVVNLDHG DPTAYEEYWR KMGDRCTVTI RGCDLMSYFS DMTNLCWFLE PELEDAIKDL HGVVGNAATE DRYIVVGTGS 101: TQLCQAAVHA LSSLARSQPV SVVAAAPFYS TYVEETTYVR SGMYKWEGDA WGFDKKGPYI ELVTSPNNPD GTIRETVVNR PDDDEAKVIH DFAYYWPHYT 201: PITRRQDHDI MLFTFSKITG HAGSRIGWAL VKDKEVAKKM VEYIIVNSIG VSKESQVRTA KILNVLKETC KSESESENFF KYGREMMKNR WEKLREVVKE 301: SDAFTLPKYP EAFCNYFGKS LESYPAFAWL GTKEETDLVS ELRRHKVMSR AGERCGSDKK HVRVSMLSRE DVFNVFLERL ANMKLIKSID L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)