AT1G70520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 2 (CRK2); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: response to ozone; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 42 (TAIR:AT5G40380.1); Has 123193 Blast hits to 121713 proteins in 4855 species: Archae - 110; Bacteria - 13886; Metazoa - 45515; Fungi - 10581; Plants - 34413; Viruses - 473; Other Eukaryotes - 18215 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:26584888..26587334 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72004.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 649 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKKEPVHILP LYLPCLLMFL LSSLRQITGD ARARAVKVTC SPLLEHNETA YVPNFVATME KISTQVQTSG FGVALTGTGP DANYGLAQCY GDLPLNDCVL 101: CYAEARTMLP QCYPQNGGRI FLDGCFMRAE NYSFYNEYKG PEDSIVCGNT TRKNKTFGDA VRQGLRNAVT EASGTGGYAR ASAKAGESES ESAFVLANCW 201: RTLSPDSCKQ CLENASASVV KGCLPWSEGR ALHTGCFLRY SDQDFLNKIP RNGRSRGSVV VIVVSVLSSV VVFMIGVAVS VYICKRRTIK RKRRGSKDVE 301: KMAKTLKDSS LNFKYSTLEK ATGSFDNANK LGQGGFGTVY KGVLPDGRDI AVKRLFFNNR HRATDFYNEV NMISTVEHKN LVRLLGCSCS GPESLLVYEY 401: LQNKSLDRFI FDVNRGKTLD WQRRYTIIVG TAEGLVYLHE QSSVKIIHRD IKASNILLDS KLQAKIADFG LARSFQDDKS HISTAIAGTL GYMAPEYLAH 501: GQLTEMVDVY SFGVLVLEIV TGKQNTKSKM SDYSDSLITE AWKHFQSGEL EKIYDPNLDW KSQYDSHIIK KEIARVVQIG LLCTQEIPSL RPPMSKLLHM 601: LKNKEEVLPL PSNPPFMDER VMELRDGSDG DSAGCASLAT VSQSSFYGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)