AT1G70410.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : beta carbonic anhydrase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a putative beta-carbonic anhydrase betaCA4. Together with betaCA1 (At3g01500) regulates CO2-controlled stomatal movements in guard cells. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
beta carbonic anhydrase 4 (BCA4); FUNCTIONS IN: carbonate dehydratase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: response to carbon dioxide, carbon utilization, regulation of stomatal movement; LOCATED IN: plasma membrane, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carbonic anhydrase, prokaryotic-like, conserved site (InterPro:IPR015892), Carbonic anhydrase (InterPro:IPR001765); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: beta carbonic anhydrase 3 (TAIR:AT1G23730.1); Has 4986 Blast hits to 4971 proteins in 1496 species: Archae - 34; Bacteria - 3845; Metazoa - 59; Fungi - 209; Plants - 361; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 478 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:26534167..26537457 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30837.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 280 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPAFGKCFM FCCAKTSPEK DEMATESYEA AIKGLNDLLS TKADLGNVAA AKIKALTAEL KELDSSNSDA IERIKTGFTQ FKTEKYLKNS TLFNHLAKTQ 101: TPKFLVFACS DSRVCPSHIL NFQPGEAFVV RNIANMVPPF DQKRHSGVGA AVEYAVVHLK VENILVIGHS CCGGIKGLMS IEDDAAPTQS DFIENWVKIG 201: ASARNKIKEE HKDLSYDDQC NKCEKEAVNV SLGNLLSYPF VRAEVVKNTL AIRGGHYNFV KGTFDLWELD FKTTPAFAFS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)