AT1G69820.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.995 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : gamma-glutamyl transpeptidase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Note that conflicting nomenclature exists in the literature: At1g69820 is named as GGT4 in Plant J. 2007 Mar 49(5):878-88; and as GGT3 in Plant Physiol. 2007 Aug 144(4):1715-32. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
gamma-glutamyl transpeptidase 3 (GGT3); FUNCTIONS IN: gamma-glutamyltransferase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 15 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Gamma-glutamyltranspeptidase (InterPro:IPR000101); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: gamma-glutamyl transpeptidase 1 (TAIR:AT4G39640.2); Has 6281 Blast hits to 6278 proteins in 1408 species: Archae - 41; Bacteria - 3599; Metazoa - 569; Fungi - 275; Plants - 85; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1712 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:26283312..26284134 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20909.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 191 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNLGDPDFVD VSKVISDMLS TNFAQGLKKK INDNKTFDPN YYGGRWDQIN DHGTSHLSII DSERNVVSLT STINSYFGAL MLSPSTGIVL NNEMDDFSIP 101: MKSSSNLTVP PPAPANFIRP GKRPLSSMTP TIVLKDGKVK ASVGASGGLY IIAGTTEVFL NYFFLKMDPL SSVLAPRIYH QLIPNIVSYE N |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)