AT1G68090.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : annexin 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a calcium-binding protein annexin (AnnAt5). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
annexin 5 (ANN5); FUNCTIONS IN: calcium-dependent phospholipid binding, calcium ion binding; INVOLVED IN: response to red or far red light, response to water deprivation, response to salt stress, response to cold, response to heat; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 8 plant structures; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage, 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Annexin like protein (InterPro:IPR015472), Annexin repeat (InterPro:IPR018502), Annexin repeat, conserved site (InterPro:IPR018252), Annexin (InterPro:IPR001464); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: annexin 7 (TAIR:AT5G10230.1); Has 4912 Blast hits to 2269 proteins in 210 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 3806; Fungi - 262; Plants - 507; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 337 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:25519442..25520774 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35995.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 316 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATMKIPMTV PSPRVDADQL FKAFKGRGCD TSVIINILAH RNATQRALIE QEYETKFSDD LRKRLHSELH GHLKKAVLLW MPEAVERDAS ILKRSLRGAV 101: TDHKAIAEII CTRSGSQLRQ IKQVYSNTFG VKLEEDIESE ASGNHKRVLL AYLNTTRYEG PEIDNASVEN DARTLKSAVA RKHKSDDQTL IQIFTDRSRT 201: HLVAVRSTYR SMYGKELGKA IRDETRGNFE HVLLTILQCA ENSCFYFAKA LRKSMKGLGT DDTALIRIVV TRAEVDMQFI ITEYRKRYKK TLYNAVHSDT 301: TSHYRTFLLS LLGPNV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)