AT1G68000.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphatidylinositol synthase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
phosphatidylinositol synthase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
phosphatidylinositol synthase 1 (PIS1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: CDP-alcohol phosphatidyltransferase (InterPro:IPR000462), CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase, eukaryote (InterPro:IPR014387); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: probable CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase 2 (TAIR:AT4G38570.1); Has 2907 Blast hits to 2907 proteins in 1088 species: Archae - 25; Bacteria - 1785; Metazoa - 167; Fungi - 194; Plants - 81; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 655 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:25491346..25492930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25862.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 227 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKKERPRPE KLSVYLYIPN IVGYMRVLLN CVAFAVCFSN KPLFSVLYFF SFCCDAVDGW VARRFNQVST FGAVLDMVTD RVSTACLLVI LSQIYRPSLV 101: FLSLLALDIA SHWLQMYSTF LAGKSSHKDV KDSTSWLFRL YYGNRIFMCY CCVSCEVLYI ILLLIAKNQS ENLLNVVVAT LTQISPLSFL LALTLFGWSM 201: KQTINVIQMK TAADVCVLYD IEKQQKP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)