AT1G67220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : histone acetyltransferase of the CBP family 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
histone acetyltransferase of the CBP family 2 (HAC2); FUNCTIONS IN: histone acetyltransferase activity, transcription cofactor activity, DNA binding; INVOLVED IN: regulation of transcription, DNA-dependent; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: shoot apical meristem, root, flower, leaf; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Histone H3-K56 acetyltransferase, RTT109 (InterPro:IPR013178), Zinc finger, TAZ-type (InterPro:IPR000197), Zinc finger, PHD-type (InterPro:IPR001965), Zinc finger, FYVE/PHD-type (InterPro:IPR011011), Zinc finger, ZZ-type (InterPro:IPR000433), Zinc finger, PHD-finger (InterPro:IPR019787); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: histone acetyltransferase of the CBP family 1 (TAIR:AT1G79000.1); Has 1838 Blast hits to 1436 proteins in 226 species: Archae - 0; Bacteria - 234; Metazoa - 975; Fungi - 55; Plants - 202; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 372 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:25145587..25150450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 155780.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1367 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MAPPRKRTRD LMPKFLNTES FDEFNQRLNN LPAESNVTSD EDAQFLESRK CQSKRWRKEE PLKLNLRSPW NVLCSPESIS SAKFIVEKTC LIPVPSFEEA 0101: ATNARRCLNT SSIPGSSGSA SETNSGSDIT KQDFKNDSPS DSKKVQGSST SKSAKPKVIK VYSFVDLVTT TKKGNIQTEE SSLNHEKKLG TVVDIVEPMK 0201: CDERSKEVQG SSTSKSAKPK VIKVYSFADV VTTTKKGNIQ TEESSLNHEK KLGTVVDIIE PMKCDERSKE VQGSSTSKSA KLKVIKVYSF ADVVTTTKKG 0301: NIQTEESSLN HEKKLGTVVD IVEPMKCDER SKEVQGSSTS KSEKPKVIKV YSFADVVTTT KKGNIQTEES SLNHEKKLGT VVDIVEPMKC DEGTKCEVTT 0401: TNKGKIHTEE RSLNHEKKLG TVVDIVEPMK CDEGSKCEVT TTNKGNTQTE ERSLNHEKKL GIGVDIVEPM KCDEGTKCEV TTTNKGKIQT EERSLNYEKK 0501: LGIGVDIVEP MKCDEENKCE VNADTFDVVI VEPMKCNKVT KCEVNVDTTG VNIVEPMKCN EVTKCEVNVD TIGVDIVEPM KCNEESKCEV NADTMSLQKR 0601: SKRAVSLVER FTEEEIKLHI MSLKKPSTQS AVEGMCDLKE EEESCQLCDD GTLLFPPQPL YCLLCSRRID DRSFYYTPGE EELSNAQHQI CSPCHSRCKT 0701: KFPLCGVFID KHKMLKRSNF DNADTEEWVQ CESCEKWQHQ ICGLYNKLKD EDKTAEYICP TCLLEECQSI NNMALVDYTD SGAKDLPETV LSYFLEQRLF 0801: KRLKEERYQT AKATGKSIND VPEPEGLTLR VVFSADRTLT VNKQFASLLH KENFPSEFPY RSKVILLFQK VHGVDICIFA LFVQEFGSEC SQPNQRSTYI 0901: FYLDSVKYFK PERVTFAGEA LRTFVYHEVL IGYLEYCKLR GFTTSYIWAC PPKIGQDYIM YSHPKTQQTP DTKKLRKWYV SMLQKAAEQR VVMNVTNLYD 1001: RFFDSTEEYM TAARLPYFEG SFWSNRAEIM IQDIEREGNN ELQKKVKLLS RRKVKTMSYK TTGDVDVDDV KNILLMEKLE KEVFPNKKDL MVVELNYSCT 1101: RCSKAVLSGL RWFCEKCKNL HLCESCYDAG QELPGEHIYK RMDKEKHQLS KVQVNGVLFS TTEDNDIIQE NDMFESRQAF LAFSQKHNYN FHTLRHAKHS 1201: SMMILHHLHT SNKHHCSQNS SSLTCTACKK DVSTTIYFPC LLCPDYRACT GCYTKNRTLR HLHIFPTLPS ANRAPSRTVM VLEILNAISH ALLCQHKTTK 1301: SCSYPKCHEV KALFTHNVQC KIRKKGTRCN TCYKLWQTIR IHVYHCQDLN CPVPQCRDRK EVLIRKV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)