AT1G66920.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.975 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT1G66910.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:24965410..24967432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 69279.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 617 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MYYLPSSCLV LFLFFSLFYH LPCASSKQTL GWCESQFQCG NITAGFPFWG GNRPEVCGHP LLELHCLDNI TSLTISDHLY HVLSINHTYN TLRVARTDFL 101: QSICLSPFPF ANATLPPEIF DILPTYKSVT LYRCYPVIPD LARYGCPAIG SVSVSDNLEN PVSCEARFTV NIPTSFVPNE KRLNITSLVR DVRNGFEVRL 201: RIDENSCQEC SSSHKYCGFT GTLPLETKCR PLNLPTRLSS EAKIATIAGV SLLPFLVLTL VVHIIRKQKT SNDKGQQDLK EHIPKPRIKA LIQLKQYSYE 301: QVKRITNSFA EVVGRGGFGI VYRGTLSDGR MVAVKVLKDL KGNNGEDFIN EVASMSQTSH VNIVTLLGFC SEGYKRAIIY EFMENGSLDK FISSKKSSTM 401: DWRELYGIAL GVARGLEYLH HGCRTRIVHF DIKPQNVLLD DNLSPKVSDF GLAKLCERKE SILSLMDTRG TIGYIAPEVF SRVYGSVSHK SDVYSYGMLV 501: LDIIGARNKT STEDTTSSTS SMYFPEWIYK DLEKGDNGRL IVNRSEEDEI AKKMTLVGLW CIQPWPLDRP AMNRVVEMME GNLDALEVPP RPVLQCSVVP 601: HLDSSWISEE NSISSEI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)