AT1G65390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phloem protein 2 A5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
phloem protein 2 A5 (PP2-A5); FUNCTIONS IN: carbohydrate binding; INVOLVED IN: signal transduction, defense response, innate immune response; LOCATED IN: intrinsic to membrane, chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Toll-Interleukin receptor (InterPro:IPR000157); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phloem protein 2-A6 (TAIR:AT5G45080.1); Has 2031 Blast hits to 1936 proteins in 66 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 2027; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:24292566..24294566 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47965.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 411 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSGASSVSSI CSSNVSLIPT GPQVFINFRG KDLRKGFMSF LKPALKKEKI NVFIDEQEER GKYLISLFDT IGESKIALVI FSEGYCESHW CMDELVKIKE 101: YMDQNRLIII PIFYRLDLDV VKDLTGKFGD NFWDLVDKYQ PEPKKLHKWT EALFSVCELF SLILPKHSDI SDRDFVKSIV KAVKKVQKNF FQRRNGEIEY 201: QDFSVPACKL TITMHESPNE EAVQVTVLNE FYQMKNQSPV PSYEFKFWVD LTRPKGNVFM IDARDLSIAW SEDSNHWTWL PLPNQNSNES VMEIAFLKSA 301: SWLDVAGKFD TRYLTPRTRY EVVFVVKLEY TFEWETLVKL KLDLPNTWEK PQEQSVDMFD YISDQWLDIP VGEFTTSKKN VGEISFAMYE HECQLWKSGL 401: FVKGVTIRPK Y |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)