AT1G64030.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.949 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : serpin 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
serpin 3 (SRP3); FUNCTIONS IN: serine-type endopeptidase inhibitor activity; INVOLVED IN: DNA repair, response to DNA damage stimulus; LOCATED IN: cytosol; EXPRESSED IN: leaf whorl, sepal, fruit, flower, inflorescence; EXPRESSED DURING: petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protease inhibitor I4, serpin (InterPro:IPR000215); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Serine protease inhibitor (SERPIN) family protein (TAIR:AT1G62170.1); Has 6508 Blast hits to 6454 proteins in 476 species: Archae - 66; Bacteria - 384; Metazoa - 5026; Fungi - 12; Plants - 344; Viruses - 461; Other Eukaryotes - 215 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:23752873..23754348 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42989.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 385 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDVREAMKNQ THVAMILSGH VLSSAPKDSN VIFSPASINS AITMHAAGPG GDLVSGQILS FLRSSSIDEL KTVFRELASV VYADRSATGG PKITAANGLW 101: IDKSLPTDPK FKDLFENFFK AVYVPVDFRS EAEEVRKEVN SWVEHHTNNL IKDLLPDGSV TSLTNKIYAN ALSFKGAWKR PFEKYYTRDN DFYLVNGTSV 201: SVPFMSSYEN QYVRAYDGFK VLRLPYQRGS DDTNRKFSMY FYLPDKKDGL DDLLEKMAST PGFLDSHIPT YRDELEKFRI PKFKIEFGFS VTSVLDRLGL 301: RSMSMYHKAC VEIDEEGAEA AAATADGDCG CSLDFVEPPK KIDFVADHPF LFLIREEKTG TVLFVGQIFD PSGPCSGSNS DSDDY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)