AT1G63050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : MBOAT (membrane bound O-acyl transferase) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
MBOAT (membrane bound O-acyl transferase) family protein; FUNCTIONS IN: acyltransferase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Membrane bound O-acyl transferase, MBOAT (InterPro:IPR004299); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MBOAT (membrane bound O-acyl transferase) family protein (TAIR:AT1G12640.1); Has 1074 Blast hits to 1071 proteins in 250 species: Archae - 0; Bacteria - 147; Metazoa - 624; Fungi - 142; Plants - 47; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 114 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:23376061..23378178 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52772.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 465 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELLDMNSMA ASIGVSVAVL RFLLCFVATI PISFLWRFIP SRLGKHIYSA ASGAFLSYLS FGFSSNLHFL VPMTIGYASM AIYRPLSGFI TFFLGFAYLI 101: GCHVFYMSGD AWKEGGIDST GALMVLTLKV ISCSINYNDG MLKEEGLREA QKKNRLIQMP SLIEYFGYCL CCGSHFAGPV FEMKDYLEWT EEKGIWAVSE 201: KGKRPSPYGA MIRAVFQAAI CMALYLYLVP QFPLTRFTEP VYQEWGFLKR FGYQYMAGFT ARWKYYFIWS ISEASIIISG LGFSGWTDET QTKAKWDRAK 301: NVDILGVELA KSAVQIPLFW NIQVSTWLRH YVYERIVKPG KKAGFFQLLA TQTVSAVWHG LYPGYIIFFV QSALMIDGSK AIYRWQQAIP PKMAMLRNVL 401: VLINFLYTVV VLNYSSVGFM VLSLHETLVA FKSVYYIGTV IPIAVLLLSY LVPVKPVRPK TRKEE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)