AT1G61550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-locus lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-locus lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, recognition of pollen; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: sperm cell, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Curculin-like (mannose-binding) lectin (InterPro:IPR001480), PAN-2 domain (InterPro:IPR013227), Apple-like (InterPro:IPR003609), S-locus receptor kinase, C-terminal (InterPro:IPR021820), EGF-like, type 3 (InterPro:IPR000742), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), S-locus glycoprotein (InterPro:IPR000858); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-locus lectin protein kinase family protein (TAIR:AT1G61490.1); Has 121113 Blast hits to 119449 proteins in 4468 species: Archae - 96; Bacteria - 13448; Metazoa - 44854; Fungi - 10099; Plants - 34551; Viruses - 435; Other Eukaryotes - 17630 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:22704866..22707826 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 89402.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 802 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTRFACFLFS TLLLSFSYAA ITPTSPLSIG QTLSSPNGIF ELGFFSPNNS RNLYVGIWFK GIIPRTVVWV ANRENSVTDA TADLAISSNG SLLLFDGKHS 101: TVWSTGETFA SNGSSAELSD SGNLLVIDKV SGITLWQSFE HLGDTMLPYS SLMYNPGTGE KRVLSSWKSY TDPLPGEFVG YITTQVPPQG FIMRGSKPYW 201: RSGPWAKTRF TGVPLTDESY THPFSVQQDA NGSVYFSHLQ RNFKRSLLVL TSEGSLKVTH HNGTDWVLNI DVPANTCDFY GVCGPFGLCV MSIPPKCKCF 301: KGFVPQFSEE WKRGNWTGGC VRRTELLCQG NSTGRHVNVF HPVANIKPPD FYEFVSSGSA EECYQSCLHN CSCLAFAYIN GIGCLIWNQE LMDVMQFSVG 401: GELLSIRLAS SEMGGNQRKK TIIASIVSIS LFVTLASAAF GFWRYRLKHN AIVSKVSLQG AWRNDLKSED VSGLYFFEMK TIEIATNNFS LVNKLGQGGF 501: GPVYKGKLQD GKEIAVKRLS SSSGQGKEEF MNEILLISKL QHINLVRILG CCIEGEERLL VYEFMVNKSL DTFIFDSRKR VEIDWPKRFS IIQGIARGLL 601: YLHRDSRLRI IHRDVKVSNI LLDDKMNPKI SDFGLARMYE GTKYQDNTRR IVGTLGYMSP EYAWTGVFSE KSDTYSFGVL LLEVISGEKI SRFSYDKERK 701: NLLAYAWESW CENGGVGFLD KDATDSCHPS EVGRCVQIGL LCVQHQPADR PNTLELLSML TTTSDLPLPK EPTFAVHTSD DGSRTSDLIT VNEVTQSVVL 801: GR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)