AT1G61480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.958 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-locus lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-locus lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, recognition of pollen; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Curculin-like (mannose-binding) lectin (InterPro:IPR001480), Apple-like (InterPro:IPR003609), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), PAN-2 domain (InterPro:IPR013227), S-locus receptor kinase, C-terminal (InterPro:IPR021820), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), S-locus glycoprotein (InterPro:IPR000858), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-locus lectin protein kinase family protein (TAIR:AT1G61490.1); Has 125416 Blast hits to 123463 proteins in 4497 species: Archae - 122; Bacteria - 13868; Metazoa - 46115; Fungi - 10812; Plants - 35535; Viruses - 455; Other Eukaryotes - 18509 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:22681420..22684404 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 90745.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 809 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKKRIMFFA SLLLITIFLS FSYAGITRES PLSIGKTLSS SNGVYELGFF SFNNSQNQYV GIWFKGIIPR VVVWVANREK PVTDSAANLT ISSNGSLLLF 101: NENHSVVWSI GETFASNGSR AELTDNGNLV VIDNNSGRTL WESFEHFGDT MLPFSNLMYN LATGEKRVLT SWKSHTDPSP GDFTVQITPQ VPSQACTMRG 201: SKTYWRSGPW AKTRFTGIPV MDDTYTSPFS LQQDTNGSGS FTYFERNFKL SYIMITSEGS LKIFQHNGMD WELNFEAPEN SCDIYGFCGP FGICVMSVPP 301: KCKCFKGFVP KSIEEWKRGN WTDGCVRHTE LHCQGNTNGK TVNGFYHVAN IKPPDFYEFA SFVDAEGCYQ ICLHNCSCLA FAYINGIGCL MWNQDLMDAV 401: QFSAGGEILS IRLASSELGG NKRNKIIVAS IVSLSLFVIL AFAAFCFLRY KVKHTVSAKI SKIASKEAWN NDLEPQDVSG LKFFEMNTIQ TATDNFSLSN 501: KLGQGGFGSV YKGKLQDGKE IAVKRLSSSS GQGKEEFMNE IVLISKLQHK NLVRILGCCI EGEERLLVYE FLLNKSLDTF LFDSRKRLEI DWPKRFNIIE 601: GIARGLHYLH RDSCLRVIHR DLKVSNILLD EKMNPKISDF GLARMYQGTE YQDNTRRVAG TLGYMAPEYA WTGMFSEKSD IYSFGVILLE IITGEKISRF 701: SYGRQGKTLL AYAWESWCES GGIDLLDKDV ADSCHPLEVE RCVQIGLLCV QHQPADRPNT MELLSMLTTT SDLTSPKQPT FVVHTRDEES LSQGLITVNE 801: MTQSVILGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)