AT1G61460.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.726 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-locus protein kinase, putative | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-locus protein kinase, putative; FUNCTIONS IN: carbohydrate binding, protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, recognition of pollen; EXPRESSED IN: stem; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: PAN-2 domain (InterPro:IPR013227), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Apple-like (InterPro:IPR003609), S-locus receptor kinase, C-terminal (InterPro:IPR021820), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), S-locus glycoprotein (InterPro:IPR000858), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-locus lectin protein kinase family protein (TAIR:AT1G61420.1); Has 110853 Blast hits to 109563 proteins in 4182 species: Archae - 79; Bacteria - 11198; Metazoa - 41616; Fungi - 9137; Plants - 32970; Viruses - 298; Other Eukaryotes - 15555 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:22674268..22676735 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 67632.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 598 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLPFSALMYN LATGEKQVLT SWKSYTNPAV GDFVLQITTQ VPTQALTMRG SKPYWRSGPW AKTRNFKLPR IVITSKGSLE ISRHSGTDWV LNFVAPAHSC 101: DYYGVCGPFG ICVKSVCKCF KGFIPKYIEE WKRGNWTDGC VRRTKLHCQE NSTKKDANFF HPVANIKPPD FYEFASAVDA EGCYKICLHN CSCLAFSYIH 201: GIGCLIWNQD FMDTVQFSAG GEILSIRLAR SELGGNKRKK TITASIVSLS LFLILGSTAF GFWRYRVKHN ASQDAPKYDL EPQDVSGSYL FEMNTIQTAT 301: NNFSLSNKLG QGGFGSVYKG KLQDGKEIAV KRLSSSSGQG KEEFMNEIVL ISKLQHKNLV RILGCCIEGE ERLLIYEFML NKSLDTFLFD SRKRLEIDWP 401: KRFDIIQGIA RGIHYLHRDS CLKVIHRDLK VSNILLDEKM NPKISDFGLA RMYQGTEYQD NTRRVVGTLG YMSPEDILEI ISGEKISRFS YGKEEKTLIA 501: YAWESWCETG GVDLLDKDVA DSCRPLEVER CIQIGLLCVQ HQPADRPNTL ELMSMLTTTS DLPSPKQPTF VVHWRDDESS SKDLITVNEM TKSVILGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)