AT1G61430.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : S-locus lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
S-locus lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, recognition of pollen; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Curculin-like (mannose-binding) lectin (InterPro:IPR001480), PAN-2 domain (InterPro:IPR013227), Apple-like (InterPro:IPR003609), S-locus receptor kinase, C-terminal (InterPro:IPR021820), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), S-locus glycoprotein (InterPro:IPR000858), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-locus lectin protein kinase family protein (TAIR:AT1G61440.1); Has 120876 Blast hits to 119144 proteins in 4455 species: Archae - 106; Bacteria - 13737; Metazoa - 44590; Fungi - 9940; Plants - 34648; Viruses - 406; Other Eukaryotes - 17449 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:22664669..22667769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 90207.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 806 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKKRIVFFA YLPFFTIFMS FSFAGITKES PFSIGQTLSS SNGVYELGFF SLNNSQNQYL GIWFKSIIPQ VVVWVANREK PVTDSAANLG ISSNGSLLLS 101: NGKHGVVWST GDIFASNGSR AELTDHGNLV FIDKVSGRTL WQSFEHLGNT LLPTSIMMYN LVAGEKRGLT AWKSYTDPSP GEFVALITPQ VPSQGIIMRG 201: STRYYRTGPW AKTRFTGSPQ MDESYTSPFI LTQDVNGSGY FSFVERGKPS RMILTSEGTM KVLVHNGMDW ESTYEGPANS CDIYGVCGPF GLCVVSIPPK 301: CKCFKGFVPK FAKEWKKGNW TSGCVRRTEL HCQGNSSGKD ANVFYTVPNI KPPDFYEYAN SQNAEECHQN CLHNCSCLAF SYIPGIGCLM WSKDLMDTRQ 401: FSAAGELLSI RLARSELDVN KRKMTIVAST VSLTLFVIFG FAAFGFWRCR VEHNAHISND AWRNFLQSQD VPGLEFFEMN AIQTATNNFS LSNKLGPGGF 501: GSVYKARNGK LQDGREIAVK RLSSSSGQGK QEFMNEIVLI SKLQHRNLVR VLGCCVEGTE KLLIYGFLKN KSLDTFVFDA RKKLELDWPK RFEIIEGIAR 601: GLLYLHRDSR LRVIHRDLKV SNILLDEKMN PKISDFGLAR MFQGTQYQEK TRRVVGTLGY MSPEYAWTGV FSEKSDIYSF GVLLLEIISG KKISSFSYGE 701: EGKALLAYAW ECWCETREVN FLDQALADSS HPSEVGRCVQ IGLLCVQHEP ADRPNTLELL SMLTTTSDLP LPKKPTFVVH TRKDESPSND SMITVNEMTE 801: SVIQGR |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)